ライフ インテリジェンス コンソーシアム（旧LINC）
理化学研究所 生命機能科学研究センター 制御分子設計研究チーム
https://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/honma-t-structure/
理化学研究所 生命機能科学研究センター (BDR)
京都大学 大学院医学研究科人間健康科学系専攻ビッグデータ医科学分野
大阪大学 蛋白質研究所 蛋白質ネットワーク生物学研究部門 計算生物学研究室（水口研）
理化学研究所 科技ハブ産連本部 (RCSTI)
公益財団法人 都市活力研究所
京都大学大学院 医学研究科 臨床薬物治療学講座/腫瘍内科
京都大学大学院 医学研究科 医学部 腎臓内科学
http://www.med.kyoto-u.ac.jp/organization-staff/research/doctoral_course/r-038/
大阪大学大学院医学系研究科 呼吸器・免疫内科学
東京大学 産学協創推進本部
https://www.ducr.u-tokyo.ac.jp/activity/research/consortium/
産総研コンソーシアム
大学間連携共同教育推進事業
神戸医療産業都市推進機構 クラスター推進センター インシリコ創薬拠点形成推進グループ
真の社会イノベーションを実現する革新的「健やか力」創造拠点（弘前大学COI）
ゲノム医療を促進する臨床ゲノム情報知識基盤の構築（AMED 臨床ゲノム情報統合DB整備事業）
創薬支援インフォマティクスシステム構築（AMED 創薬支援推進事業）
神戸リサーチコンプレックス協議会
生体分子システムの機能制御による革新的創薬基盤の構築（理化学研究所 ポスト「京」重点課題１）
「富岳」成果創出加速プログラム
プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進
「富岳」成果創出加速プログラム
「富岳」で目指すシミュレーション・AI駆動型次世代医療・創薬
新エネルギー・産業技術総合開発機構 新薬開発を効率化・加速する製剤処方設計AIの開発
（NEDO 次世代人工知能・ロボット中核技術 グローバル研究開発分野）